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真新镇·大木研究所
在一片青青草地上，有个少年呆坐着，似是思考什么入了神……
“呀！”地一声，少年猛地惊醒，起身转头，看清肇事者是谁后又自顾自地呆坐下来。
“小叶，想什么这么入神？万一刚好肯泰罗经过这里你咋办？当活靶子啊！”在少年身后，一名少女叉着腰，气鼓鼓地说着。
“小熙，谢谢你……”少年起身离去，只留下一句似是意蕴非凡的话语。
少年名叫小叶，是一名孤儿，三年前被人在河里发现并救下，在医生抢救下保住了性命，却好似失忆一般对这里的一切都不熟悉，但大脑偏偏没有一点问题。医生束手无策，然后交由大木博士观察，希望能从神奇宝贝上找到失忆的答案。大木博士查看了所有已知神奇宝贝的资料也没能找到失忆的原因，又不舍得让小叶继续流离，便收养了他，这一养就是三年。
少女名叫小熙，大木博士的孙女，生性活泼，单纯可爱。在小叶来到这里后，就喜欢捉弄他，但每次都被他华丽地无视，偶尔回应也只是平淡的几句话。
这次竟然……向自己道谢？活见鬼了？？还是他脑子真出问题了？？？
一开始来到这个世界，知道发生了什么之后。我总是避免和别人有太大的关系，担心自己会影响一些事情。现在……我想通了！既然让我来到这个世界，为何不为自己考虑一下呢……
而这时的小叶，似乎下了某个决心，径直走向研究所大厅……
“哦~是小叶啊，这么急着找我是有什么事啊？如果是什么烦心事的话千万不要憋着，尽管说，不然总是一副苦瓜脸，脸僵硬了可是会固定的哟~”大木博士还是这样，总是一本正经地调侃自己，一副老顽童的样子。
“倒不是什么烦心事……只是……”小叶正要说下去，却被大木博士一个抬手打断了。
“你指的是申请新人训练家的事情吧……”突然，大木博士的脸色有点尴尬起来。见小叶点了点头，大木博士接着说：“你虽然已经年满10岁，也通过了新人训练家考核，只是申请新人训练家需要本人的身份证件和本地居住证，当初救下你的人并没有在你身上发现任何可以证明身份的东西，所以这个……”
“看来是我自作多情了……”小叶顿时垂头丧气地说道。
“当然是尽量给你争取到了呀！哈哈哈……”紧接着大木博士笑着说：“我自作主张收你做我的孙子，给你办了身份证件和本地居民证，然后申请新人训练家的同时还顺便帮你报名了石英联盟，本来还担心你小子不领情呢……”
“大木博士！”小叶激动地跳到了大木博士的身上，搞得大木博士大喊腰疼……
“明天就是新人训练家出发的日子，趁着今天和你的朋友好好玩玩，记得明天不要迟到哦~”大木博士拍了拍小叶的肩，随后回研究所照看新人神奇宝贝去了，为了确保新人训练家收到的是活力四射的神奇宝贝，大木博士简直忙的比那些神奇宝贝的父母还要“父母”……
“沉寂了三年，刻意将自己与这个世界隔离，错过了太多了呢……”小叶望着蔚蓝的天空，感叹道。
“只不过，莫名成了大木博士的孙子，为啥感觉那么别扭呢……”苦笑一声，小叶回到草地上，思考起明天的事来。
最初从真新镇出发的四个新人训练家，我、小茂和小智，那么最后一个是谁呢？
这时，一道倩影出现在他的脑海里。如果是她的话，我的旅行可要糟糕了呢……
作为新人神奇宝贝的三只，杰尼龟被小茂选走了，小智由于迟到最后拿走了有问题的皮卡丘。那么剩下来就只有小火龙和妙蛙种子了。
离真新镇最近的常磐市的常磐道馆，是板木的地盘，这时候的板木有超梦坐镇，现在的自己去挑战简直是送菜。第二个道馆是尼比市的尼比道馆，第三个道馆又是花篮市的花篮道馆，这样的话选妙蛙种子在前期是相当有利的。但妙蛙种子及其进化型始终是单一的草系，不利于后面道馆的挑战，小火龙虽然一开始处于劣势，但它的进化型喷火龙却是火飞双属性，对于挑战枯叶市的枯叶道馆，彩虹市的彩虹道馆和红莲岛的红莲道馆具有相当大的优势。
就这样，时间悄然滑落，转眼已是星星点点，明月皎皎。今天的夜，注定有人睡不着觉（小智），也注定有人坐守到天亮（小茂），而我……当然是早早地躺在草地上睡觉啦……
翌日清晨，我一拍身上的尘土，带着崭新的自己，去迎接自己的第一只神奇宝贝。本以为自己是第一个到的，然理想是美好的，现实是残酷的……在自己的前面，早早就有两人在等着了。
其中一人自然是坐守到天亮的小茂，另外一个……
“嗨！小叶，原来你也是新人训练家啊，这样的话我们可以一起旅行了呢！”听这声音就知道是小熙，原来自己最终没能逃过她的魔爪……
“是啊，很荣幸能和你一起旅行……”与其想着怎么避开，还不如试着融入，或许才是正确的吧。
小熙见小叶竟然这般回答，一时间竟然呆在了原地。就好像眼前的小叶，不是她所认识的小叶一般……
“喂！小叶，见到我不打声招呼，只顾着撩妹可不厚道哦……”说着，小茂走了过来，手肘搭在小叶的肩上，笑道。不管旁边突然面色羞红的小熙，他悄咪咪地说：“不用装成这样吧，想跑直说呀……不过我劝你呀，还是别跑了，她有道具鞋，那速度……”
“哥哥，你和小叶聊什么呢……”见到俩人那差点就抱上的姿势，小熙顿时气鼓鼓地说道。
“哦~在聊小智那个小子呢，平时一副无所事事的样子也就罢了，现在可是新人训练家出发的日子耶，他竟然还迟到。我们商量着教育教育他呢，是吧小叶……”看到小茂那暗示的眼神，小叶随即说道：“嗯……确实是这样没错……”
“哟！你们都到了啊~”这时，大木博士不紧不慢地走了过来。“那么就按来的顺序开始吧！”语音刚落，原本空无一物的桌子上多了几个洞，从洞里便钻出了三个神奇宝贝球，球上分别带有不同的标签来辨认神奇宝贝，比如：妙蛙种子就是一片叶子标签……
“供新人训练家使用的神奇宝贝分别是杰尼龟，妙蛙种子和小火龙，相关的资料你们也看过了，就开始选吧。”大木博士简单点了几下神奇宝贝球，便一脸微笑地站在一边了。
“我选杰尼龟！”果不其然，小茂选了杰尼龟。
“我选妙蛙种子！”小熙激动地说道。但听到这个，小叶顿时叫惨，果然女孩子还是比较喜欢呆萌的妙蛙种子的吗……
“那我选小火龙好了……”嘴上虽这么说，心里却是：还有的选吗？苍天不公啊……
“还有，这些是新人训练家用的神奇宝贝图鉴和精灵球，收好。”随即，桌子上又出现三个神奇宝贝图鉴和15个缩小的精灵球，分成了三份。
收完东西后，按理说应该去前面接受邻里的欢送，以期平安顺利。但小叶却是往后面走……
“怎么……不去接受邻里的欢送吗？好歹也是一份心意啊……”大木博士看着那离去的背影，感到了一丝孤独。
“不用了，在这里接受祝福，不如在石英高原上接受祝贺来的真切……”留下一句话后，小叶迈上了他的旅途。
“这小子……或许可以为真新镇带来一个惊喜吧……哎呀，不好！”呢喃着，似是想起了什么，撒腿就往研究所里跑。。
“那只皮卡丘又惹事了吧……”看着大木博士那滑稽的样子，小叶心里有着一种说不出的感觉。同时也为收到皮卡丘的小智默哀一句：祝你好运~
是时候该出发了呢……