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徐然靠着一张嘴就把郑氏内部分化，成功赶回台湾岛这一事迹很快就传遍朝野。特别是经过后来传播者的加工神化，把徐然说得像诸葛亮转世一样足智多谋。此时的吴三桂忙于称帝的事情，无暇顾及清庭与其他两个藩王的对抗。
由于郑氏家族的败退，原来被占领的福建泉州、漳州、广东的汕头又全部转回到了清军的手上。眼下，清军面对的是两个选择，一是先攻打平南王尚可喜，由于他已被困良久，无论是人员士气还是粮草都已经接近谷底，但就怕赶狗入穷巷到时被疯狗反咬；另一个选择是攻打靖南王耿精忠，虽然他失去泉州、漳州两个屏障，但他的军队一直处于以逸待劳的状态，士气正盛。
徐然正想修书告诉康熙前方的战况以及自己的想法时，就收到驿使送来的信件。徐然打开，面露喜悦。“果然皇上跟我的想法不谋而合。”
徐然立刻召集佟养甲到军营，“佟总督，现在收到皇上的谕旨，你把你的20万大军分成两小队，一队5万人由我带领前往广州，佯攻尚可喜的老巢。实际上，是由你带队15万精锐兵力偷袭耿精忠。记住，你每次发动进攻时必须选在深夜，切忌恋战。到时耿精忠这边的部分兵力肯定是分往尚可喜那边，所以他经不起你的几次突袭，很快就会军力空虚。到时你再携所有兵力前来广州支援我，定能一次擒获两藩王。”徐然露出自信的笑容。
佟养甲听后，皱起了眉头“这个计策想法是很好，但你凭什么认为耿精忠会愿意出兵救尚可喜呢？万一他全部主力据守福州城，到时恐怕我这边难以招架。”
“佟总督放心，我不是相信耿精忠对尚可喜的拯救情义，而是相信耿精忠对广东地盘的贪婪。”
佟养甲听后，连连点头就退去。
翌日，徐然大张旗鼓地带着号称15万精兵奔赴广州，剿灭尚可喜。尚可喜那边听到这个消息，又在加紧修书向耿精忠和吴三桂求救。耿精忠还是一贯的做法，表面应和，实际上还是排除军队慢慢地前进，等待双方的鱼死网破再图渔人之利。
徐然带着军队马不停蹄，三天后便赶到了广州城外，对尚可喜的军队发起了攻击，尚可喜全力反抗。第一回合，战至傍晚，双方打成平手而鸣金收兵。
佟养甲听着徐然那边传来的消息，他这边继续按兵不动。耿精忠看着佟养甲这边没有反应，但还是丝毫不敢松懈，继续加强值守。
到了第二天，徐然又再故技重施，向尚可喜发起正面进攻，但每次一到傍晚，不论胜负，都赶紧收兵。如是者，重复了10天。而佟养甲这边一直按兵不动。
耿精忠这边从开始的恐防有诈，逐渐到后来，他也相信了清军的主力部队在徐然手中，佟养甲这边兵力有限，不敢贸然进攻。
时间来到了第十一天，徐然命人带口信给佟养甲，示意他今晚可以正式突袭了。而这一天，徐然还是一早就是向尚可喜发起攻击，双方继续厮杀僵持到傍晚。此时，徐然并没有鸣鼓收兵，反而吹起号角增加了兵力，调遣了火炮兵在后面加强进攻。尚可喜对于他的突然变阵显得有点措手不及，赶紧撤退关闭城门。徐然继续命令军队加强进攻。
广州的战场消息很快传动耿精忠耳朵里，他断定徐然已经试探完尚可喜的实力，此次是真的要攻城，他便命令他的精锐部队加快步速，前往广州准备分一杯羹。
时至深夜，佟养甲带兵兵分三路突袭福建的福州城、三明和莆田。耿精忠闻讯，赶紧抽调福州兵力分往三明、莆田助守。由于三明、莆田、南平、宁德四地的主要兵力已赶往广东等待收割。所以此四地的兵力十分空虚。佟养甲按照徐然的部署，战至第二天清晨并鸣金收兵。
佟养甲又再故技重施，夜里兵分三路突袭耿精忠的军队，不过此次就换成了福州城、南平和宁德。耿精忠又赶紧从三明、莆田调兵助守。到了第二天的清晨，佟养甲又再收兵。。
如是者过了五天，耿精忠的军队由于疲于奔命，加上战死过半。于第六天正式开门求和。就这样，三藩中的靖南王耿精忠率先投降。
尚可喜那边听到了耿精忠求和的消息，打算拼死一搏，带领亲兵在晚上从从化边界突围，结果被迎面前来援助的佟养甲军队刺杀。最后，尚可喜的长子尚之信带头投降。就这样，三藩中的平南王尚可喜也被收拾了。这两藩的余下部队全部被清军收编了，此时三藩之乱只剩下吴三桂一方了。